data_DI
# 
_chem_comp.id                                    DI 
_chem_comp.name                                  "2'-DEOXYINOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" 
_chem_comp.type                                  "DNA LINKING" 
_chem_comp.pdbx_type                             ATOMN 
_chem_comp.formula                               "C10 H13 N4 O7 P" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2001-06-01 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         OIP 
_chem_comp.formula_weight                        332.207 
_chem_comp.one_letter_code                       I 
_chem_comp.three_letter_code                     DI 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   Y 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        ? 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
DI OP3    O3P  O 0 1 N Y N ?      ?      ?     0.339  -0.227 -4.868 OP3    DI 1  
DI P      P    P 0 1 N N N 61.863 1.854  4.986 1.592  -1.245 -4.964 P      DI 2  
DI OP1    O1P  O 0 1 N N N 62.553 1.821  3.701 2.575  -0.951 -6.059 OP1    DI 3  
DI OP2    O2P  O 0 1 N N N 61.488 3.190  5.614 0.886  -2.697 -5.051 OP2    DI 4  
DI "O5'"  O5*  O 0 1 N N N 62.730 1.116  6.017 2.211  -1.232 -3.468 "O5'"  DI 5  
DI "C5'"  C5*  C 0 1 N N N 62.869 -0.279 5.966 1.348  -1.500 -2.377 "C5'"  DI 6  
DI "C4'"  C4*  C 0 1 N N R 64.276 -0.596 6.398 2.156  -1.432 -1.088 "C4'"  DI 7  
DI "O4'"  O4*  O 0 1 N N N 64.509 -2.015 6.640 2.678  -0.093 -0.958 "O4'"  DI 8  
DI "C3'"  C3*  C 0 1 N N S 65.465 -0.054 5.595 1.309  -1.697 0.152  "C3'"  DI 9  
DI "O3'"  O3*  O 0 1 N N N 66.497 0.204  6.513 2.127  -2.250 1.180  "O3'"  DI 10 
DI "C2'"  C2*  C 0 1 N N N 65.793 -1.280 4.755 0.878  -0.312 0.578  "C2'"  DI 11 
DI "C1'"  C1*  C 0 1 N N R 65.589 -2.419 5.757 2.101  0.516  0.211  "C1'"  DI 12 
DI N9     N9   N 0 1 Y N N 65.144 -3.696 5.266 1.818  1.923  -0.049 N9     DI 13 
DI C8     C8   C 0 1 Y N N 65.733 -4.905 5.635 1.431  2.464  -1.253 C8     DI 14 
DI N7     N7   N 0 1 Y N N 65.106 -5.938 5.081 1.248  3.768  -1.186 N7     DI 15 
DI C5     C5   C 0 1 Y N N 64.065 -5.367 4.341 1.530  4.073  0.114  C5     DI 16 
DI C6     C6   C 0 1 N N N 63.073 -6.003 3.576 1.498  5.359  0.762  C6     DI 17 
DI O6     O6   O 0 1 N N N 62.956 -7.253 3.442 1.196  6.400  0.193  O6     DI 18 
DI N1     N1   N 0 1 N N N 62.195 -5.116 2.969 1.856  5.247  2.113  N1     DI 19 
DI C2     C2   C 0 1 N N N 62.250 -3.698 3.091 2.196  4.035  2.726  C2     DI 20 
DI N3     N3   N 0 1 N N N 63.228 -3.090 3.861 2.227  2.870  2.145  N3     DI 21 
DI C4     C4   C 0 1 Y N N 64.072 -3.969 4.431 1.883  2.958  0.840  C4     DI 22 
DI HOP3   3HOP H 0 0 N N N -0.449 0.022  0.837 -0.163 -0.014 -5.684 HOP3   DI 23 
DI HOP2   2HOP H 0 0 N N N 60.548 3.226  5.745 0.508  -2.990 -5.907 HOP2   DI 24 
DI "H5'"  1H5* H 0 1 N N N 62.677 -0.655 4.950 0.551  -0.756 -2.359 "H5'"  DI 25 
DI "H5''" 2H5* H 0 0 N N N 62.145 -0.760 6.640 0.917  -2.495 -2.497 "H5''" DI 26 
DI "H4'"  H4*  H 0 1 N N N 64.275 -0.006 7.327 3.008  -2.117 -1.157 "H4'"  DI 27 
DI "H3'"  H3*  H 0 1 N N N 65.301 0.862  5.008 0.475  -2.383 -0.018 "H3'"  DI 28 
DI "HO3'" H3T  H 0 0 N Y N 67.325 0.262  6.051 2.928  -1.706 1.218  "HO3'" DI 29 
DI "H2'"  1H2* H 0 1 N N N 66.801 -1.256 4.316 0.008  0.008  -0.009 "H2'"  DI 30 
DI "H2''" 2H2* H 0 0 N N N 65.128 -1.373 3.884 0.635  -0.225 1.641  "H2''" DI 31 
DI "H1'"  H1*  H 0 1 N N N 66.593 -2.566 6.181 2.853  0.503  1.007  "H1'"  DI 32 
DI H8     H8   H 0 1 N N N 66.589 -4.991 6.288 1.301  1.856  -2.138 H8     DI 33 
DI H1     H1   H 0 1 N N N 61.467 -5.502 2.402 1.869  6.091  2.678  H1     DI 34 
DI H2     H2   H 0 1 N N N 61.521 -3.090 2.577 2.448  4.153  3.791  H2     DI 35 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
DI OP3   P      SING N N 1  
DI OP3   HOP3   SING N N 2  
DI P     OP1    DOUB N N 3  
DI P     OP2    SING N N 4  
DI P     "O5'"  SING N N 5  
DI OP2   HOP2   SING N N 6  
DI "O5'" "C5'"  SING N N 7  
DI "C5'" "C4'"  SING N N 8  
DI "C5'" "H5'"  SING N N 9  
DI "C5'" "H5''" SING N N 10 
DI "C4'" "O4'"  SING N N 11 
DI "C4'" "C3'"  SING N N 12 
DI "C4'" "H4'"  SING N N 13 
DI "O4'" "C1'"  SING N N 14 
DI "C3'" "O3'"  SING N N 15 
DI "C3'" "C2'"  SING N N 16 
DI "C3'" "H3'"  SING N N 17 
DI "O3'" "HO3'" SING N N 18 
DI "C2'" "C1'"  SING N N 19 
DI "C2'" "H2'"  SING N N 20 
DI "C2'" "H2''" SING N N 21 
DI "C1'" N9     SING N N 22 
DI "C1'" "H1'"  SING N N 23 
DI N9    C8     SING Y N 24 
DI N9    C4     SING Y N 25 
DI C8    N7     DOUB Y N 26 
DI C8    H8     SING N N 27 
DI N7    C5     SING Y N 28 
DI C5    C6     SING N N 29 
DI C5    C4     DOUB Y N 30 
DI C6    O6     DOUB N N 31 
DI C6    N1     SING N N 32 
DI N1    C2     SING N N 33 
DI N1    H1     SING N N 34 
DI C2    N3     DOUB N N 35 
DI C2    H2     SING N N 36 
DI N3    C4     SING N N 37 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
DI SMILES           ACDLabs              10.04 "O=C1c2ncn(c2N=CN1)C3OC(C(O)C3)COP(=O)(O)O"                                                                                                      
DI SMILES_CANONICAL CACTVS               3.341 "O[C@H]1C[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(O)=O)n2cnc3C(=O)NC=Nc23"                                                                                        
DI SMILES           CACTVS               3.341 "O[CH]1C[CH](O[CH]1CO[P](O)(O)=O)n2cnc3C(=O)NC=Nc23"                                                                                             
DI SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1nc2c(n1[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)O)O)N=CNC2=O"                                                                                         
DI SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1nc2c(n1C3CC(C(O3)COP(=O)(O)O)O)N=CNC2=O"                                                                                                      
DI InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C10H13N4O7P/c15-5-1-7(21-6(5)2-20-22(17,18)19)14-4-13-8-9(14)11-3-12-10(8)16/h3-7,15H,1-2H2,(H,11,12,16)(H2,17,18,19)/t5-,6+,7+/m0/s1" 
DI InChIKey         InChI                1.03  PHNGFPPXDJJADG-RRKCRQDMSA-N                                                                                                                      
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
DI "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 
;2'-deoxy-5'-inosinic acid
;
DI "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(6-oxo-1H-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
DI "Create component"  2001-06-01 RCSB 
DI "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB 
# 
